Toruń posiada bardzo rozbudowaną sieć transportu publicznego. Funkcjonują tu dziesiątki linii autobusowych i kilka tramwajowych. Dogodną komunikację w obrębie miasta zapewnia również kolej. W mieście znajdują się też 44 postoje TAXI, Przejazd taksówką w granicach administracyjnych miasta to koszt około 6 zł za pierwszy kilometr i 3,5 zł za każdy kolejny.
W Toruniu działa także lotnisko sportowo-turystyczne, posiadające w swojej ofercie m.in. loty turystyczne nad miastem. Widok toruńskiej starówki z lotu ptaka to niezapomniane przeżycie dla każdego turysty. Na terenie Torunia w 2015 roku znajdowało się blisko 100km dróg rowerowych: głównych – łączących dzielnice i prowadzą za miasto, zbiorczych – rozprowadzają ruch rowerowy w dzielnicach oraz lokalnych – obsługujących ruch na terenie osiedli.
Miasto jest bogate w infrastrukturę rowerową, na którą składają się setki stojaków rowerowych, zadaszone parkingi rowerowe oraz trzy samoobsługowe stacje naprawy rowerów. mieszkańcy i goście Torunia mogą korzystać z programu „Toruński Rower Miejski”. Do dyspozycji miłośników dwóch kółek jest 260 rowerów i jak dotąd 27 stacji zlokalizowanych w różnych częściach miasta tak, aby umożliwić szybkie i sprawne poruszanie się w przestrzeni publicznej. Wypożyczalnia rowerów w Toruniu cieszy się dużym zainteresowaniem. W 2014 roku mieszkańcy i goście skorzystali z niej 42 tysiące razy. W sezonie turystycznym oferowane są również inne, dodatkowe formy komunikacji, ułatwiające zwiedzanie miasta, np. statki i łodzie turystyczne, riksze i dorożki.